税金の中で、中小企業が気を付けねばならないのが「従業員の所得税の源泉徴収税」である。
2012年度の源泉税の租税滞納状況では、法人税の滞納よりも多く、2400億円の滞納額となっている。

消費税も企業にとっては大きな負担であり、消費税の滞納状況は1位で滞納額は3960億円と、法人税の滞納額の2.5倍である。

税金の滞納発生額の5割以上が消費税である。