2011年度の国の財務書類によると、東京大学には国からの出資金として1兆35億4900万円が継ぎこまれている。

大阪大学2684億4300万円、京都大学2445億2600万円、九州大学1462億5100万円、東北大学1802億2000万円、北海道大学1545億8300万円と比べると桁違いの額となっている。